Сергей Кожугетович родился 21 мая 1955 года в Тувинской АССР в городе Чадан. Отец Сергея, Кожугет Шойгу много лет проработал заместителем председателя Совета министров Тувинской АССР, мать – экономист. Сразу после окончания школы (1972 год) Сергей Шойгу поступил в Красноярский политехнический институт на специальность «инженер-строитель». В 1996 году получил ученую степень, после защиты диссертации.

Окончив институт Сергей Кожугетович до 1985 года работал по специальности на стройке. Начал он с простого мастера, затем стал начальником участка, прорабом, после главным инженером. С 1985 года Шойгу возглавлял тресты «Саянтяжстрой» и «Абаканвагонстрой» в городе Абакан.

С 1988 года начинается политическая карьера Шойгу, он получает должность второго секретаря комитета КПСС в Абакане, а через год его назначают инспектором Красноярского краевого комитета КПСС. В начале девяностых Сергей Кожугетович переводится в Москву, работает заместителем председателя Госкомитета по строительству и архитектуре.

С 1991 года Сергей Шойгу возглавляет Госкомитет Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий. С созданием МЧС изменяется и статус Шойгу, теперь он министр. На этой должности он остается и до сих пор.

Осенью 1999 года Сергей Кожугетович возглавляет движение «Единство». Зимой этого же года его избирают депутатом Госдумы, но Шойгу отказывается от предложенного поста и остается министром по чрезвычайным ситуациям.  В сентябре 1999 года Сергей Шойгу получает звание Героя России. Имеет ордена: «за личное мужество», «За заслуги перед Отечеством» (третьей степени), Серебряный Крест I степени «За достойное выполнение воинского и гражданского долга», «Данакер». В 2003 году ему присвоено звание Генерал армии.